河道石笼网箱广泛应用在内河河流，主要有加固河堤和引导水流。加固河堤的石笼网网箱，一般在堤坝内侧，主要是应用在河水流速比较湍急的地方，河水冲刷石笼网，而非直接冲刷河堤，这样减轻对河堤的损害。
石笼网也可以用于引导河流水，河流一般会顺着固有的河槽流动，河道可能有自然形成的弯曲的河道，如果发生洪水，水量巨大，水流湍急，水流会在惯性下，趋于直向流动，会猛烈地冲击原来的河槽和堤坝，有可能使河流改道，那样将造成巨大的灾难。
为了减轻湍急的水流冲刷河堤，在河堤的内侧或者河槽的边缘，铺石笼网箱或者石笼网垫，汹涌的河水直接冲击石笼网箱或者石笼网垫，这样保护河堤或者河槽。
河水在弯曲的河道处，由于遇到石笼网箱或者石笼网垫，河水就会拐弯，顺着固有的河道流淌。这样就引导河水按安全的。
石笼网也应用到泄洪坝和导流坝，起到引导或者约束洪水的作用。