纯化水的质量取决于源水的水质及纯化水制备系统的组成和处理能力。纯化水制备系统的配置应根据源水水质、水质变化、用户对纯化水质量的要求、投资费用、运行费用等技术经济指标综合考虑确定。

结合国际市场的趋势，二级反渗透装置较为适用于医药行业。
  反渗透系统在常温条件下运行，反渗透装置并不具备可靠的抗微生物污染的能力。
  使用反渗透系统来制造质量要求较高的纯化水，至少要两个反渗透处理单元串联，即采用两级反渗透系统。此外，反渗透单元的下游管路中还应安装大功率的紫外线杀菌灯，以控制反渗透器的出水的微生物指标。
  紫外线杀菌装置由外壳、紫外线灯管、石英套管及电气设施等组成。紫外线照射量大于 3000 μ W · s/cm2 ，灯管寿命一般不短于 700h 。
  紫外线杀菌器后面安装过滤器，一般要求滤膜孔径≤ 0.45 μ m 。
  微孔过滤的类型按滤膜结构可分为深层过滤、表面过滤和膜过滤；按滤膜作用可分为澄清过滤、预过滤和终端过滤。
  孔径为 0.22 ц m 的滤膜则主要适用于用水点的终端过滤以及纯化水和注射用水贮罐的呼吸用除菌过滤。

   微孔过滤膜的特点：
   a 、具有确定性、对杂质颗粒及细菌的绝对截留性；
   b 、均匀分布的孔径，对滤液表面阻力小，滤速快；
   c 、无纤维成分脱落；
   d 、可除去小的杂质颗粒，可灭菌，也可去除极微小的病毒。

GMP认证制药纯化水生物医药用纯水制备工艺流程
　　传统工艺： ? 原水－原水加压泵－多介质过滤器－活性炭过滤器－软水器－周密过滤器－一级反渗透 设备－中间水箱－中间水泵－离子交换器－纯化水箱－纯水泵－紫外线杀菌器－微孔过滤器－用水点
　　新工艺：
　　? 原水－原水加压泵－多介质过滤器－活性炭过滤器－软水器－周密过滤器－一级反渗透机－中间水箱－中间水泵－EDI系统－纯化水箱－纯水泵－紫外线杀菌器－微孔过滤器－用水点
　　新工艺：
　　? 原水－原水加压泵－多介质过滤器－活性炭过滤器－软水器－周密过滤器－第一级反渗透 －PH调节－中间水箱－第二级反渗透（反渗透膜表面带正电荷）－纯化水箱－纯水泵－紫外线杀菌器－ 微孔过滤器－用水点
　　新工艺：
　　? 原水― 多介质过滤器―活性炭过滤器― 盐箱― 软化过滤器― 软化水箱― 药洗水箱― 保安过滤器― 一级反渗透装置― 二级反渗透装置― RO纯水箱― EDI超纯水装置― 超纯水箱― 蒸馏水器― 用水点