绞吸式挖泥船的工作是通过一根吸管和吸管头部的搅拌器进行工作的。将吸管伸到水底，开动搅拌器将水底的泥沙搅成泥浆后，用吸管将泥浆吸出，通过管道送到堆积场地。
耙吸挖泥船是通过安装在链上的挖泥斗将水底的淤泥挖出，存放在船上或挖泥船边的驳船上。
绞吸式挖泥船和耙吸挖泥船的各自特点是绞吸式挖泥船工作效率高，能在相对较深的水底挖泥，但因为是管道运送淤泥，离淤泥堆积场不能太远。耙吸挖泥船的特点正好相反。