三线闭壳龟是一种色彩丰富的闭壳龟。它的背甲呈棕色上有三条清晰的黑色带状纹，侧面的二条比中间的那条短。三条黑线分别位于中龙骨和二条侧棱上。腹甲几乎全黑，只有周边的少数部分为黄色。下面的缘盾为橘红色间有小黑斑。狭而尖的头部色彩丰富，头顶部是黄色、绿色或橄榄色。头部两侧各有一条宽的镶有黄色、绿色或橄榄色边眶的黑色条纹从其鼻部向后延伸。微呈钩状的上颌是黄色的，有一条黄色的条纹从嘴部向后延伸。下颌也呈黄色，但颈的下部是粉红色或橙色的。四肢的腋窝和四肢的下部为橘红色，上部为棕色、灰色或橄榄绿色。背甲比其它的闭壳龟更长厚。虽然腹甲可闭合，但后半片腹甲由于太小而不能盖住后肢。肛盾的中部有一大的V形缺口。雄性的腹甲微凹。雄性通常有一粗长的尾巴，其泻殖孔离背甲的边缘较远。
    背甲长100～200 mm。头大小适中，头背皮肤光滑。吻略突出于上颚，上颚微钩曲。背甲较低，具三棱，脊棱突出。腹甲与背甲略等长，前缘平，后缘凹入。背腹甲以韧带相连，腹甲胸、腹盾间亦以韧带相连，前后二叶可动，并能向上闭合背甲。四肢较扁，指、趾间全蹼。尾长而尖细。头背鲜黄或橄榄黄色，头侧栗色。背甲淡棕色或淡棕黑色，三条背棱为棕黑色，腹甲黑褐色，边缘黄色。
    头顶部是黄色、绿色或橄榄色。头部两侧各有一条宽的镶有黄色、绿色或橄榄色边眶的黑色条纹从其鼻部向后延伸。下颌也呈黄色，颈下部是粉红色或橙色。四肢的腋窝和四肢的下部为橘红色，上部为棕色、灰色或橄榄绿色。三条背棱为棕黑色，腹甲黑褐色，边缘黄色。