水經過加熱后形成水垢，其主要成分是硬度垢，也就是鈣、鎂離子垢。水經過旁流水處理器，在脈衝低壓電場作用下使水分子排列有序，使其成垢離子間的排列順序發生變化，阻止鈣鎂離子形成晶核，進而達到防垢除垢的目的。

   實踐和研究証明，設備及金屬管道內壁在介質為0~90℃的水中，腐蝕的主要方式是電化學腐蝕（微電池效應），次要方式是氧腐蝕和熱腐蝕等。因此，控制電化學腐蝕就成了消除黃鏽水現象、控制管網腐蝕的主要辦法。旁流水處理器在不改變水的生化屬性的前提下，通過脈衝低壓電場改變了水分子的排列順序，大大降低了電導率，使電化學腐蝕的通路受到抑制；另外，改變了金屬與非金屬離子間的電位差，也使腐蝕減弱，在完全無污染的情況下，從根本上達到了根治腐蝕、消除黃鏽水的目的

   水中菌藻生殖繁殖需要一定的環境，旁流水處理器是利用脈衝低壓電場來破坏細菌的細胞表面、破坏細菌的活性酶系統，停止其新陳代謝，使細菌生存環境改變，從而達到殺菌滅藻的目的。