純化水的質量取決于源水的水質及純化水制備系統的組成和處理能力。純化水制備系統的配置應根據源水水質、水質變化、用戶對純化水質量的要求、投資費用、運行費用等技術經濟指標綜合考慮確定。

結合國際市場的趨勢，二級反滲透裝置較為適用於醫藥行業。
  反滲透系統在常溫條件下運行，反滲透裝置並不具備可靠的抗微生物污染的能力。
  使用反滲透系統來製造質量要求較高的純化水，至少要兩個反滲透處理單元串聯，即採用兩級反滲透系統。此外，反滲透單元的下游管路中還應安裝大功率的紫外線殺菌燈，以控制反滲透器的出水的微生物指標。
  紫外線殺菌裝置由外殼、紫外線燈管、石英套管及電氣設施等組成。紫外線照射量大於 3000 μ W · s/cm2 ，燈管壽命一般不短于 700h 。
  紫外線殺菌器後面安裝過濾器，一般要求濾膜孔徑≤ 0.45 μ m 。
  微孔過濾的類型按濾膜結構可分為深層過濾、表面過濾和膜過濾；按濾膜作用可分為澄清過濾、預過濾和終端過濾。
  孔徑為 0.22 ц m 的濾膜則主要適用於用水點的終端過濾以及純化水和注射用水貯罐的呼吸用除菌過濾。

   微孔過濾膜的特點：
   a 、具有確定性、對雜質顆粒及細菌的絕對截留性；
   b 、均勻分布的孔徑，對濾液表面阻力小，濾速快；
   c 、無纖維成分脫落；
   d 、可除去小的雜質顆粒，可滅菌，也可去除極微小的病毒。

GMP認証製藥純化水生物醫藥用純水制備工藝流程
　　傳統工藝： ? 原水－原水加壓泵－多介質過濾器－活性炭過濾器－軟水器－週密過濾器－一級反滲透 設備－中間水箱－中間水泵－離子交換器－純化水箱－純水泵－紫外線殺菌器－微孔過濾器－用水點
　　新工藝：
　　? 原水－原水加壓泵－多介質過濾器－活性炭過濾器－軟水器－週密過濾器－一級反滲透機－中間水箱－中間水泵－EDI系統－純化水箱－純水泵－紫外線殺菌器－微孔過濾器－用水點
　　新工藝：
　　? 原水－原水加壓泵－多介質過濾器－活性炭過濾器－軟水器－週密過濾器－第一級反滲透 －PH調節－中間水箱－第二級反滲透（反滲透膜表面帶正電荷）－純化水箱－純水泵－紫外線殺菌器－ 微孔過濾器－用水點
　　新工藝：
　　? 原水― 多介質過濾器―活性炭過濾器― 鹽箱― 軟化過濾器― 軟化水箱― 藥洗水箱― 保安過濾器― 一級反滲透裝置― 二級反滲透裝置― RO純水箱― EDI超純水裝置― 超純水箱― 蒸餾水器― 用水點