絞吸式挖泥船的工作是通過一根吸管和吸管頭部的攪拌器進行工作的。將吸管伸到水底，開動攪拌器將水底的泥沙攪成泥漿后，用吸管將泥漿吸出，通過管道送到堆積場地。
耙吸挖泥船是通過安裝在鏈上的挖泥斗將水底的淤泥挖出，存放在船上或挖泥船邊的駁船上。
絞吸式挖泥船和耙吸挖泥船的各自特點是絞吸式挖泥船工作效率高，能在相對較深的水底挖泥，但因為是管道運送淤泥，離淤泥堆積場不能太遠。耙吸挖泥船的特點正好相反。