在其廢水處理中，含有大量的有機物，耗氧是有機廢水的特點，所以對有機廢水的處理，多採用生物化學法。

食品工業廢水排入水體的有機物，在好氧菌及充足的氧氣供給情況下，進行好氧分解變為無機物質，這一分解過程稱為生物氧化過程。採用人工措施，培養水中微生物，輸進足夠的氧，以促進有機物的生化分解進程，這就是好氧生物處理法的實質。

有機廢水的生物好氧處理具有如下優點：生化反應速度快、好氧消化設備簡單，基建投資較少、運行穩定操作簡單。好氧處理一般適用於處理中、低濃度的有機廢水。

有機廢水的好氧生物處理方法主要有活性污泥法、生物膜法、曝氣塘法和膜生物反應器法。