三線閉殼龜是一種色彩豐富的閉殼龜。它的背甲呈棕色上有三條清晰的黑色帶狀紋，側面的二條比中間的那條短。三條黑線分別位於中龍骨和二條側稜上。腹甲幾乎全黑，只有週邊的少數部分為黃色。下面的緣盾為橘紅色間有小黑斑。狹而尖的頭部色彩豐富，頭頂部是黃色、綠色或橄欖色。頭部兩側各有一條寬的鑲有黃色、綠色或橄欖色邊眶的黑色條紋從其鼻部向后延伸。微呈鉤狀的上頜是黃色的，有一條黃色的條紋從嘴部向后延伸。下頜也呈黃色，但頸的下部是粉紅色或橙色的。四肢的腋窩和四肢的下部為橘紅色，上部為棕色、灰色或橄欖綠色。背甲比其它的閉殼龜更長厚。雖然腹甲可閉合，但后半片腹甲由於太小而不能蓋住后肢。肛盾的中部有一大的V形缺口。雄性的腹甲微凹。雄性通常有一粗長的尾巴，其瀉殖孔離背甲的邊緣較遠。
    背甲長100～200 mm。頭大小適中，頭背皮膚光滑。吻略突出於上顎，上顎微鉤曲。背甲較低，具三稜，脊稜突出。腹甲與背甲略等長，前緣平，后緣凹入。背腹甲以韌帶相連，腹甲胸、腹盾間亦以韌帶相連，前後二葉可動，並能向上閉合背甲。四肢較扁，指、趾間全蹼。尾長而尖細。頭背鮮黃或橄欖黃色，頭側栗色。背甲淡棕色或淡棕黑色，三條背稜為棕黑色，腹甲黑褐色，邊緣黃色。
    頭頂部是黃色、綠色或橄欖色。頭部兩側各有一條寬的鑲有黃色、綠色或橄欖色邊眶的黑色條紋從其鼻部向后延伸。下頜也呈黃色，頸下部是粉紅色或橙色。四肢的腋窩和四肢的下部為橘紅色，上部為棕色、灰色或橄欖綠色。三條背稜為棕黑色，腹甲黑褐色，邊緣黃色。