貫通式貨架又稱通廊式貨架、駛入式貨架。此系統貨架排布密集，空間利用率極高，幾乎是托盤式貨架的兩倍，但貨物必須是少品種大批量型，貨物先進后出。首先須進行集裝單元化工作，確定托盤的規格、載重量及堆高。由此確定單元貨架的跨度、深度、層間距，根據屋架下沿的有效高度確定貨架的高度。靠牆區域的貨架總深度最好控制在6個托盤深度以內，中間區域可兩邊進出的貨架區域總深度最好控制在12個托盤深度以內，以提高叉車存取的效率和可靠性(此類貨架系統中，叉車為持續“高舉高打”作業方式，叉車易晃動而撞到貨架，故穩定性的考慮充分與否至關重要)。此類倉儲系統穩定性較弱，貨架不宜過高，通常應控制在10m以內，且為了加強整個貨架系統的穩定性，除規格、選型要大一些外，還須加設拉固裝置。單托貨物不宜過大、過重，通常重量控制在1500kg以內，托盤跨度不宜大於1.5m。常配叉車為前移式電瓶叉車或平衡重電瓶叉車。適合存儲大批量、品種少的貨物，進出庫頻繁的行業，如冷庫食品、飲料、原料庫、乳制品等行業。又稱駛入式貨架，叉車可以直接進入巷道內存儲貨物，倉庫利用率高。存取方式為先進后出，造價低。可用最小的空間提供最大的儲存量。與橫梁式貨架相同，先確定托盤的形式、規格、尺寸，物品高度及重量，然後對存儲物品每一個品種的托盤數量做統計，從而決定貨架的高度、深度、跨度及層高等等，可以度身定製。採用駛入式托盤貨架系統可以實現存儲管理的專業化、標準化。