南瓜籽油含豐富的營養物質，食用價值很高。除主要含有ω-6系列多不飽和脂肪酸外，南瓜籽油還含有植物甾醇、胡蘿蔔素、多種維生素果膠、氨基酸和礦物質元素。其具有降低血糖、降低膽固醇的食療作用，同時南瓜籽油中還含有一種可稱為男性荷爾蒙的生物活性物質，對泌尿系統及前列腺增生具有良好的治療和預防作用。